В настоящее время он является самым большим в России высшим учебным заведением, осуществляющим подготовку инженерных кадров из числа офицерского и старшинского состава для Военно-Морского Флота и Федеральной пограничной службы, а также для Федеральной службы безопасности и управлений Министерства обороны Российской Федерации. Институт осуществляет также подготовку инженеров для Военно-морских сил дружественных стран на основе межгосударственных договоров.
История института насчитывает более 200 лет и ведет свое начало с 20 (31) августа 1798 года, когда Законом Российской империи № 18634, Высочайше утвержденным императором Павлом I, в Санкт-Петербурге было основано Училище корабельной архитектуры – Первое в мире военно-морское инженерное учебное заведение.

Более 130 лет оно размещалось в здании Главного Адмиралтейства. Постановлением Правительства Российской Федерации от 29 августа 1998 года и приказом Министра Обороны Российской Федерации от 16 сентября 1998 года были объединены два существовавших в то время учебных заведения – Высшее Военно-морское инженерное ордена Ленина училище имени Ф.Э. Дзержинского и Высшее военно-морское инженерное училище имени В.И. Ленина и образован Военно-морской инженерный институт, который, как и Военно-морской ордена Красной Звезды институт радиоэлектроники имени А.С.Попова, в 2009 году вошёл в состав единого Военного учебно-научного центра Военно-морского флота «Военно-морская академия», аккумулировавшего в себе практически всю подготовку кадров в интересах Военно-морского флота.
Кадеты поучаствовали в конкурсе капитанов-старпомов, который проходил в рамках Недели военной науки Военно-морского политехнического института, побывали в учебных корпусах, казармах и музее института.